Scrats fjollede jagt på det flygtige agern, som han har jaget siden tidernes morgen, fører til en kontinental naturkatastrofe. Det starter et kæmpe eventyr for Manny, Diego og Sid. Sid bliver genforenet med sin krakilske bedstemor, og gruppen støder på en flok sørøvere, der vil gøre alt for at forhindre vennerne i at komme hjem.